当前全球流行的 HIV‑1 主要分为 M、N、O、P 四组，其中 M 组进一步划分为 9 个纯亚型（A–D、F–H、J、K）与超过 100 种已命名的流行重组型。
在中国，CRF01_AE 与 CRF07_BC 是两大优势流行重组型，广泛分布于不同地区与高危人群，为病毒重组提供了持续的遗传基础。男男性行为者MSM因其高风险行为模式，长期处于 HIV‑1 新发感染与病毒演化的前沿，是新型重组毒株出现与扩散的关键人群。
近期，云南省疾病预防控制中心团队在中国病毒学《Virologica Sinica》发表了题为“Identification of a novel HIV-1 circulating recombinant form (CRF161_0107) from CRF01_AE-C5 lineage among men who have sex with men in southwestern China”的最新研究，正式鉴定并命名一株源自西南地区 MSM 人群的新型 HIV‑1 流行重组型 ——CRF161_0107，系统解析了其基因组结构、进化起源与公共卫生意义，为我国 HIV‑1 分子监测与精准防控提供了关键依据。
本研究采用近全长基因组测序与系统进化分析，明确 CRF161_0107 为CRF01_AE 与 CRF07_BC 的嵌合重组体。基于重组断点精确定位，该毒株基因组被 5 个断点划分为 6 个交替排列的片段，依次为：I‑CRF01_AE（760–3959 nt）、II‑CRF07_BC（3960–6120 nt）、III‑CRF01_AE（6121–6347 nt）、IV‑CRF07_BC（6348–8231 nt）、V‑CRF01_AE（8232–8484 nt）、VI‑CRF07_BC（8485–9513 nt）。这种高度嵌合且稳定的结构特征，证实其为可稳定传播的二代流行重组型，而非宿主体内一过性重组产物。
分子钟进化分析显示，CRF161_0107 约于2016 年左右出现，经数年人群传播后被监测发现，提示该毒株已具备一定的传播适应性与人群扩散能力。
进一步的谱系溯源结果揭示了该毒株独特的跨区域起源，CRF161_0107 携带的 CRF01_AE 片段并非云南本地主流流行谱系，而是归属于中国北方地区流行的 CRF01_AE‑C5 分支；其 CRF07_BC 片段则源自 CRF07_BC‑N 谱系。这是中国西南地区首次报道由 CRF01_AE‑C5 谱系参与形成的 HIV‑1 流行重组型，直接证明 MSM 人群的跨区域流动可驱动不同地理来源病毒株相遇并重组，进而催生新型毒株。
这一发现突破了既往对区域内病毒独立演化的认知，凸显人群流动性在 HIV‑1 宏观进化中的关键驱动作用，也提示我国HIV‑1 传播已呈现区域交融、谱系混合的复杂态势。
值得注意的是，新型重组毒株的持续出现，提示 MSM 人群仍是我国 HIV‑1 变异与传播的高风险节点，现有检测、干预与治疗策略需进一步提升精准度。而跨区域重组事件的证实，要求我国建立覆盖更广、协同更强的 HIV‑1 分子监测网络，实现毒株变异、传播链与地理扩散的实时追踪与预警。
除此之外，CRF161_0107 的鉴定丰富了中国 HIV‑1 重组毒株谱系库，为本土疫苗设计、抗病毒药物研发与耐药突变监测提供关键的真实世界毒株数据。研究团队明确指出，HIV‑1 在高危人群中仍处于活跃重组与持续演化状态，必须将分子流行病学监测纳入常规防控体系，结合行为干预、检测咨询与规范抗病毒治疗，构建阻断新型毒株扩散的综合防线。
简而言之，云南疾控团队发现的 HIV‑1 CRF161_0107，不仅是我国西南地区 HIV‑1 分子进化的重要新证据，更是全球 HIV‑1 重组格局中具有代表性的本土案例。
参考链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1995820X26000453?via=ihub
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